利用imageJ自动细胞计数基于软件自带工具Analyze Particles

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首先对图片进行预处理

将RGB的照片转换为8-bit的灰阶图

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继续进行Threshold

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勾选Dark background或者调节Red颜色

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下方比例尺为红色,调节第二行颜色项目转换为白色

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有些细胞染色结果不算太好,调节第一行颜色项目增加对比

image-20211213152437126image-20211213152516109image-20211213152540922image-20211213152552817

Apply应用形成二值化的细胞,此图可以打断细胞,但是打断之前填补细胞空洞

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随后进行细胞分割

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进入Analyze Particles

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注意size,多大的颗粒进行细胞计数

利用放大镜找到图片中较小的细胞,利用圆形工具圈起来,进行面积比对

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Area158

将下限改为150

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出现结果,并且出现每个的面积,后续慢慢识别控制排除错误细胞